天净沙211216-100可调式易错 PCR 试剂盒
北京天净沙基因科技有限公司,是一家聚焦科研试剂、动物检验检疫、分子诊断的研发和生产企业。自创建以来,公司秉承“因为全在心上,所以不在话下"的经营理念,坚持把核心技术放在心上、把产品质量放在心上、把用户服务放在心上的三项原则,让所有困难都不在话下。
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211216-100天净沙 可调式易错 PCR 试剂盒,产品简介:
产品品牌:天净沙
产品名称:可调式易错 PCR 试剂盒
产品货号:211216-100
产品规格:100次
211216-100天净沙 可调式易错 PCR 试剂盒
产品及特点
易错PCR(Error-prone PCR)是利用Taq DNA多聚酶不具有3′→5′校对功能的特性,在一定条件下(如不同的dNTP浓度、Mg浓度和MnCl2存在)能够按较高的机率引入随机引入突变。如果有适当的选择方法,则可从构建的突变库选出所需突变体。本产品是在本公司的易错PCR试剂盒的基础上改进而得,本
产品具有下列特点:
1. 即开即用,十分简单方便,尤其在生物制药和酶学研究领域显示出了它的优越性。
2. 配方经过精心优化,实验人员在一定范围内可以控制突变率,一轮PCR的突变率范围在2-8突变/1000bp,更高的突变率可以通过多轮PCR达到。
3. 可用于连续易错PCR(sequential error-prone PCR),只需把上一次易错PCR的产物用作下一次易错PCR的模板即可,使每一次获得的小突变累积而产生重要的有益突变。
4. 可以扩增的DNA片段更长,达到2kb,对于2kb以上的产物,建议分段扩增。
5. 本试剂盒足够100次30uL体系的易错PCR。
6. 本产品只能用于科研。
规格及成分
本产品采用五孔盒包装
成份 | 编号 | 规格 | 包装材料 |
可调易错PCR专用 Taq DNA聚合酶(5U/uL) | 101005c | 50 uL | 0.5mL红盖管 |
5×可调易错PCR Mix(含dNTP | 211216a | 600 uL | 0.5mL黄盖管 |
可调易错PCR专用MnCl2 | 211216c | 300 uL | 0.5mL紫盖管 |
可调易错PCR专用dGTP | 211216d | 300 uL | 0.5mL蓝盖管 |
10×可调易错PCR追加dNTP | 211216e | 300 uL | 0.5mL本色管 |
使用手册 | 211216sc | 1份 | 无 |
运输及保存
低温运输,-20℃保存, 有效期为一年
自备试剂
引物、DNA模板、常规PCR试剂盒
使用方法
1. 将引物稀释到10uM。引物也是决定易错PCR成败的关键因素,设计引物时要保证其Tm在70℃,长度在25-30nt之间,GC含量在45%-60%之间,3端GC含量低,并且没有发夹结构。
2. 用自备易错PCR引物和自备的常规PCR试剂扩增制备易错DNA模板(常规PCR产物),胶回收并准确确定浓度。注意:易错PCR的模板一定要用胶回收的常规PCR产物,因为胶回收会可以把电泳不可见的非特异性扩增片段去除,否则这些片段由于也是用易错PCR引物扩增所得,在易错PCR扩增时也会被扩增,产生竞争抑制,降低靶分子的扩增效率。
3. 将回收的DNA片段(模板)稀释到1ng/uL 、10ng/uL和100ng/uL三个浓度。注意:模板使用量是影响突变率的最重要因素,模板DNA为非突变DNA,扩增产生的DNA为突变DNA,易错PCR体系最终DNA量是基本固定的,因此模板DNA使用量越大,则突变DNA在终产物中的相对比例就越低,突变率就越低。故建议同时测试三个模板用量。如果都成功,则优先选用模板浓度低的PCR产物进行分析。
4. 根据每1000bp的预期突变数按下表确定30uL易错PCR体系中MnCl2和dGTP的用量(这是在模板DNA不超过1ng的前提下的数据)。表中的Mn表示可调易错PCR专用的MnCl2, dG表示可调易错PCR专用的dGTP:
预期突变数 | 2个 | 3个 | 4个 | 5个 | 6个 | 7个 | 8个 |
Mn用量(uL) | 0 | 1.0 | 2.5 | 4.0 | 4.0 | 4.0 | 4.0 |
dG用量(uL) | 0 | 0 | 0 | 1.0 | 2.0 | 3.0 | 4.0 |
5. 设置30uL体系的可调易错PCR:第一次建议设置3个模板浓度。在3干净的PCR管中,分别加入下列成分。最后加可调易错PCR专用MnCl2
成分 | 模板用量1 | 模板用量2 | 模板用量3 |
可调易错PCR Mix, 5× | 6 uL | 6 uL | 6 uL |
可调易错PCR 专用dGTP | 根据上步用量表表选择 | 根据上步用量表表选择 | 根据上步用量表表选择 |
自备DNA模板 | 1 uL (1ng/uL) | 1 uL (1ng/uL) | 1 uL (1ng/uL) |
自备PCR引物 (10 uM each) | 1 uL each | 1 uL each | 1 uL each |
可调易错PCR专用 Taq DNA聚合酶 | 0.5 uL | 0.5 uL | 0.5 uL |
可调易错PCR 专用MnCl2 | 根据上步用量表表选择 | 根据上步用量表表选择 | 根据上步用量表表选择 |
自备超纯水 | 补水到30uL | 补水到30uL | 补水到30uL |
6. 按已经优化的常规PCR条件进行易错PCR:
PCR前变性 | 94℃ 3分钟 |
易错PCR(循环30-60次 | 94℃ 1分钟 |
60℃ 1分钟 |
72℃ 3-10分钟 |
注:由于易错PCR含高浓度的镁离子,因此容易形成引物二聚体,因此需要使用较高的复性温度,以避免小片段扩增产物竞争性抑制PCR。易错PCR一般不需要热启动,也不需要在易错PCR结束后做延伸处理。易错PCR循环次数越多,突变DNA(扩增产物)与非突变DNA(原始模板)的比例就越高。此外在突变率和模板长度恒定的情况下,扩增次数越多,发生突变的绝对数就越高,在同一模板上发生的突变位点数就越多,所以如果需要,可以做30、35、40、45、50、55、60次7个循环数的比较
7. 易错PCR结束后,取3uL进行电泳检查。
8. 如果有预期大小的PCR产物,则全部电泳,进行胶回收,再进行克隆和测序等后续操作。如果需要增加突变率,可以选择一个突变后的DNA为模板,再进行下一轮易错PCR。
9. 如果没有预期大小的PCR产物,可以按下列操作追加进行一轮常规PCR(追加PCR)。
10. 在PCR管中,加入3uL 10×可调易错PCR专用追加dNTP到27uL电泳剩下的PCR体系中,按下表进行追加PCR(chasing PCR)。注意追加PCR只做20次循环。
步骤 | 参数 | 循环数 |
追加PCR | 94℃ 1分钟 | 循环20次 |
60℃ 1分钟 |
72℃ 1分钟 |
11. 追加PCR结束后,再电泳检测。如果有条带,再进行克隆和测序等后续操作。如果需要增加突变率,可以选择一个突变后的DNA为模板,再进行下一轮易错PCR。
12. 如果没有预期大小的PCR产物,则需要分析原因
疑难解答
Q:现象:没有PCR产物。
A:可能原因:一是引物没有优化,可以重新设计引物;二是模板DNA太少,可以增加用量;三是模板不纯,最好先胶回收;四是DNA溶液中有EDTA,可以适当补加Mg++。
Q:现象:太多的PCR条带或PCR条带模糊一片。
A:可能原因:一是模板有胶回收、二是PCR循环数太多;三是复性温度太低;四是引物没有优化;五是PCR条件没优化,可以使用touch-down PCR。
Q: 如果需要更高的突变率,如何办?
A: 可以使用连续多次易错PCR来提高突变率。但最好先用胶纯化回收易错PCR片段,再用于下一轮易错PCR。
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