Bio-Rad公司近日宣布推出ddPCR™ Genome Edit Detection Assays，可利用微滴式数字PCR（ddPCR）技术来鉴定CRISPR/Cas9所产生的编辑。

CRISPR/Cas9基因组编辑是一种强大的技术，但编辑效果往往取决于多个实验条件，包括使用的细胞类型、转染方法、目标序列，以及其他许多因素。基因组编辑的成功率通常不高，以干细胞为例，成功的基因组编辑也许不到5%。

目前有许多方法可评估基因组编辑的效率，包括新一代测序（NGS）和高分辨率熔解分析等，不过它们在时间、成本或性能上或多或少存在不足。例如，NGS的周转时间通常为几周，而且分析很复杂，这使其不大适合常规筛选。此外，为了提高灵敏度，人们需要对同一DNA多次测序，这大大增加了时间和成本。

如今，借助Bio-Rad的ddPCR技术，研究人员能够在更短的时间内，以更低的成本来精确评估基因组编辑的效果。这种技术将样本分成数千个微滴，大大提高了信噪比，让用户可定量极其稀有（频率低至0.5%）的编辑，并在一天之内获得结果。

ddPCR与CRISPR强强联合，已在多篇论文中发表。2015年，杜克大学在《Science》上发表了一种基于ddPCR的方法，来检测那些治疗小鼠杜氏肌营养不良的基因编辑。第二年，《Nature Protocols》和《Scientific Reports》也发表了详细的ddPCR策略，以便评估基因组编辑的效果。最近，Broad研究院的研究人员也利用ddPCR来验证一种基于CRISPR的核酸检测平台的灵敏度。

《Nature Protocols》论文的作者、德国汉堡-埃本德多夫大学医疗中心的教授Boris Fehse表示：“基因组编辑不仅在基础和应用科学中大有希望，在基因治疗领域更是如此。治疗应用需要高度灵敏、可靠且容易开展的检测来监控效率及潜在的副作用。在我看来，数字PCR是满足这些需求的理想工具。”

Bio-Rad的数字PCR检测是基于水解探针的。它们能够与QX200 微滴式数字PCR系统结合使用，以出色的准确性、精确性和灵敏度对目标DNA分子进行绝对定量。现在，用户可通过Bio-Rad的Digital Assay 网站，来指定他们的序列并订购检测