ddPCR技术已经应用在多个方面，包括定量癌症标志物、测定病毒载量、区分基因组变异、验证新一代测序的结果、基因表达分析、转基因检测以及环境监测等等。此外，您还可以利用ddPCR技术来检验CRISPR/Cas9的基因组编辑效果。

目前市场主流的是三家：

1、赛默飞世儿的3D数字PCR（芯片式数字PCR），主要是将20ul反应体系分散到20000个微孔中进行反应,变成20000个反应体系，PCR反应结束后，采用CCD拍照，数阳性反应孔。

2、Bio-Rad的微滴数字PCR（油包水原理）：将20ul反应体系采用液滴反应器形成20000个油包水反应体系，PCR反应结束后，才有流式细胞术的原理，检测每一个液体，数阳性反应的液滴数量。

3、RainDance 的数字PCR（油包水原理）、原理与伯乐微滴数字PCR相同，但是其液体形成能力比伯乐强很多，理论上可以产生1000万个小油滴。

相对于荧光定量PCR(qPCR)而言，dPCR具备以下优势：

无需依赖参考物或标准品

通过使用更多PCR复制物能够提高精确度

对抑制剂具有较高耐受性

能够分析复杂混合物

对较小倍数改变的线性检测